.. link:
.. description:
.. tags:
.. date: 2013/08/29 14:26:34
.. title: Vědecké programování v Pythonu
.. slug: index

Tato stránka slouží k výuce předmětu *Vědecké programování v Pythonu* (12PYTH) na ČVUT FJFI.
Náplň kurzu najdete v materiálech níže a také v `sylabu </PythonFJFIsylabus.pdf>`_.

Informace k `letnímu semestru 2023/2024 </letni-semestr-20232024.html>`_ (rozvrh, podmínky zápočtu, témata zápočtových prací apod.).

Kontakt: Jakub Urban.

Komunikace na Discord serveru: https://discord.gg/Zczh2w9JxY. Připojte se do kanálu `ls-23-24 <https://discord.com/channels/1080243489427693693/1206270870218080267>`_.

První lekce 15. 2.
==================
**První lekce proběhne samostatně.**

#. Samostatně si projděte lekci `První krůčky </posts/prvni-krucky.html>`_. Je třeba, abyste si vyzkoušeli a ověřili funkčnost prostředí pro výuku.
#. Projděte si také dvě úvodní lekce `Proč Python? </posts/proc-python.html>`_ a `Úvod </posts/uvod.html>`_.

Otázky a komentáře ideálně sdílejte na Discordu, aby se diskuze rovnou dostala i k ostatním.


Co se tady naučíte
==================

* Jak jednoduše nainstalovat a spustit Python a spoustu užitečných doplňků.
* Obecné základy programování v Pythonu, které jsou nezbytné pro efektivní použití pro vědecké použití.
* Používat metody moderní softwarového inženýrství, např. jednotkové testy.
* Práci se základními vědeckými knihovnami: numpy, scipy, matplotlib, pandas apod.
* Kdy a jak optimalizovat a paralelizovat (nejen) Python kód.
* Samostatnou práci na vlastním Python projektu.


Materiály
=========
Materiály k výuce jsou postupně doplňovány a aktualizovány.
Zdrojové IPython (Jupyter) notebooky najdete také na
`Gitlab <https://gitlab.com/coobas/numerical_python_course>`_.

#. `Proč Python? </posts/proc-python.html>`_
#. `Úvod </posts/uvod.html>`_
#. `První krůčky </posts/prvni-krucky.html>`_
#. `Nástroje </posts/nastroje.html>`_
#. `Základní syntaxe </posts/zakladni-syntaxe.html>`_
#. `Datové typy: čísla a řetězce </posts/zakladni-typy.html>`_
#. `Datové typy: Kontejnery </posts/kontejnery.html>`_
#. `Objektově orientované programování </posts/objektove-orientovane-programovani.html>`_
#. `Iterátory a generátory </posts/iteratory-a-generatory.html>`_
#. `Funkcionální programování v Pythonu </posts/funkcionalni-programovani-v-pythonu.html>`_
#. `Moduly </posts/moduly.html>`_
#. `Výjimky </posts/vyjimky.html>`_
#. `Jak python loví štěnice </posts/jak-python-lovi-stenice.html>`_
#. `Jednotkové testy </posts/jednotkove-testy.html>`_
#. `Práce s řetězci a se soubory </posts/prace-s-retezci-a-se-soubory.html>`_
#. `Vytváříme Python projekt </posts/vytvarime-python-projekt.html>`_
#. `Základy Numpy </posts/zaklady-numpy.html>`_
#. `Grafy s Matplotlib </posts/matplotlib.html>`_
#. `Plotly pro interaktivní vizualizaci </posts/plotly-pro-interaktivni-vizualizaci.html>`_
#. `Vědecká knihovna SciPy </posts/vedecka-knihovna-scipy.html>`_
#. `Symbolický a sympatický SymPy </posts/symbolicky-a-sympaticky-sympy.html>`_
#. `Optimalizace až na Cost </posts/optimalizace-az-na-cost.html>`_
#. `Paralelní výpočty </posts/paralelni-vypocty.html>`_
#. `Slepování jazyků pomocí Pythonu </posts/slepovani-jazyku-pomoci-pythonu.html>`_
#. `Pandas </posts/jak-pandy-analyzuji-data.html>`_

Literatura
==========

Volně přístupná
---------------

-  `Python`_ – oficiální dokumentace.
-  `Nauč se Python`_
-  `Lectures on scientific computing with Python by R. Johansson`_
-  `A Whirlwind Tour of Python by Jake Vanderplas`_
-  `Python Data Science Handbook by Jake Vanderplas`_
-  `Jake Vanderplas Introduction to Scientific Computing in Python (lecture notes)`_
-  `A Crash Course in Python for Scientists`_
-  `Python Scientific Lecture Notes`_
-  `Slides <http://www.southampton.ac.uk/~fangohr/training/python/pdfs/Python-for-Computational-Science-and-Engineering-slides.pdf>`_, `textbook <http://www.southampton.ac.uk/~fangohr/training/python/pdfs/Python-for-Computational-Science-and-Engineering.pdf>`_ and other resources from `Python Programming Primer by Hans Fangohr`_
-  `Software Carpentry - Programming with Python`_
-  `Scientific Computing with Python (Programming Bootcamp for biology graduate students)`_
-  `Data Carpentry Python for Ecologists`_
-  `Google's Python Class`_
-  `Codecademy Python`_
-  `Online Python Tutor`_
-  `M. Pilgrim: Dive Into Python 3`_ (`český překlad`_)
-  `Z.A. Shaw: Learn Python The Hard Way`_
-  `Seriál létající cirkus na root.cz`_
-  `B. Eckel: Python 3 Patterns & Idioms`_
-  Mnoho další zajímavé literatury najdete např. na `pythonbooks.revolunet.com`_, `python.cz`_ nebo `py.cz`_.


Knihy
-----

- `Ian Ozsvald and Micha Gorelick: High Performance Python <https://www.oreilly.com/library/view/high-performance-python/9781449361747/>`_
- `Anthony Scopatz, Kathryn D. Huff: Effective Computation in Physics: Field Guide to Research with Python <https://books.google.cz/books?id=6IkNCgAAQBAJ&printsec=frontcover&dq=Effective+Computation+in+Physics+Field+Guide+to+Research+with+Python&hl=cs&sa=X&redir_esc=y#v=onepage&q=Effective%20Computation%20in%20Physics%20Field%20Guide%20to%20Research%20with%20Python&f=false>`_
- `Rubin H. Landau, Manuel J Páez, Cristian C. Bordeianu: Computational Physics: Problem Solving with Python <http://eu.wiley.com/WileyCDA/WileyTitle/productCd-3527413154.html>`_
- `John Guttag: Introduction to Computation and Programming Using Python <http://books.google.cz/books?id=pVP8AQAAQBAJ&printsec=frontcover&dq=Guttag+-+Introduction+to+computation+and+programming+using+Python&hl=en&sa=X&ei=UvnyU-iNLYX17AbVmIEo&redir_esc=y#v=onepage&q=Guttag%20-%20Introduction%20to%20computation%20and%20programming%20using%20Python&f=false>`_
- `Wes McKinney: Python for Data Analysis <https://www.oreilly.com/library/view/python-for-data/9781491957653/>`_
- `Aurélien Géron: Hands-On Machine Learning with Scikit-Learn, Keras, and TensorFlow <https://www.oreilly.com/library/view/hands-on-machine-learning/9781492032632/>`_
- `Hans Petter Langtangen: A Primer on Scientific Programming with Python <http://books.google.cz/books?id=xOOmROafkxkC&printsec=frontcover&dq=langtangen+python&hl=en&sa=X&ei=0mosUoXHL-bt0gWv2YCwBA&ved=0CDIQ6AEwAA#v=onepage&q=langtangen%20python&f=false>`_
- `Hans Petter Langtangen: Python Scripting for Computational Science <http://books.google.cz/books?id=YEoiYr4H2A0C&printsec=frontcover&dq=langtangen+python&hl=en&sa=X&ei=0mosUoXHL-bt0gWv2YCwBA&ved=0CDgQ6AEwAQ#v=onepage&q=langtangen%20python&f=false>`_

Srovnání Python a Matlab
------------------------
- `MATLAB vs Python: Why and How to Make the Switch <https://realpython.com/matlab-vs-python/>`_



.. _Python: http://www.python.org
.. _Google's Python Class: https://developers.google.com/edu/python/
.. _A Crash Course in Python for Scientists: http://nbviewer.ipython.org/5920182
.. _Online Python Tutor: http://www.pythontutor.com/
.. _Python Scientific Lecture Notes: http://scipy-lectures.github.com
.. _`M. Pilgrim: Dive Into Python 3`: http://getpython3.com/diveintopython3
.. _český překlad: http://diveintopython3.py.cz
.. _`Z.A. Shaw: Learn Python The Hard Way`: http://learnpythonthehardway.org
.. _pythonbooks.revolunet.com: http://pythonbooks.revolunet.com/
.. _`Seriál létající cirkus na root.cz`: http://www.root.cz/serialy/letajici-cirkus/
.. _python.cz: http://python.cz/
.. _py.cz: http://www.py.cz/TutorialyLiteratura
.. _`B. Eckel: Python 3 Patterns & Idioms`: https://bitbucket.org/BruceEckel/python-3-patterns-idioms/
.. _`Scientific Computing with Python (Programming Bootcamp for biology graduate students)`: http://nbviewer.ipython.org/url/atwallab.cshl.edu/teaching/QBbootcamp3.ipynb
.. _`Lectures on scientific computing with Python by R. Johansson`: https://github.com/jrjohansson/scientific-python-lectures
.. _`Jake Vanderplas Introduction to Scientific Computing in Python (lecture notes)`: https://github.com/jakevdp/2014_fall_ASTR599
.. _`Codecademy Python`: http://www.codecademy.com/tracks/python
.. _`Software Carpentry - Programming with Python`: http://swcarpentry.github.io/python-novice-inflammation
.. _`Data Carpentry Python for Ecologists`: http://www.datacarpentry.org/python-ecology/
.. _`A Whirlwind Tour of Python by Jake Vanderplas`: https://github.com/jakevdp/WhirlwindTourOfPython
.. _`Python Data Science Handbook by Jake Vanderplas`: https://github.com/jakevdp/PythonDataScienceHandbook
.. _`Python Programming Primer by Hans Fangohr`: http://www.southampton.ac.uk/~fangohr/training/python/
.. _`Nauč se Python`: https://naucse.python.cz/courses/